该队创建于1904年，于1941年首次升入甲级。1946年后几度沉浮，1991年 再次回归甲级行列。自从重返甲级后，每一个赛季无时不刻不给巴塞罗那、皇家马德里等大牌球队制造着巨大压力。该队之所以崛起，得益于巴西球星。自贝贝托加盟后，在过去六七年时间内，先后有近20位巴西球员在该队效力过。在1999/2000赛季的西甲联赛中，该队异军突起，力压巴塞罗那和皇家马德里两强，成为了联赛冠军，这也许标志着该队迎来一个新的黄金时期。
在21世纪的初期，拉科鲁尼亚足球俱乐部打破了西甲传统的巴塞罗那与皇家马德里争夺联赛冠军的局面，在年的联赛里勇夺西甲联赛桂冠。由此，拉科鲁尼亚开始了在欧洲最高级别的俱乐部赛事上的演出，而SuperDepor的高峰也再次到来，其中就包括上演了欧洲冠军杯历史上最不可思议的一次逆转——在里亚索4：0战胜上届卫冕冠军AC米兰。自从重返甲级后，拉科鲁尼亚足球俱乐部每一个赛季无时不刻不给巴塞罗那、皇家马德里等大牌球队制造着巨大压力。但也许是经验不足，火候不到，这支盼望甲级联赛冠军许久的球队每每到最后一刻失足，令球迷无可奈何。不过，该队的崛起在西班牙很受欢迎，因为它的崛起使西班牙足坛从三强鼎立到四强争雄，从此它也获得了“超级拉科”的称号。该队之所以崛起，得益于巴西球星。自贝贝托加盟后，在六七年时间内，先后有德贾明哈、里瓦尔多、毛罗·席尔瓦等近20位巴西球员在该队效力过。在1999/2000赛季的西甲联赛中，该队终于压过了巴塞罗那和皇家马德里两强，成为了联赛冠军。
进入到21世纪以来，以贝莱隆为灵魂并拥有特里斯坦和马凯两大射手的拉科鲁尼亚发挥更趋稳定，曾经连续五个赛季稳居西班牙三甲之列，并且在欧洲赛场主客场均击败过曼联、阿森纳、AC米兰、尤文图斯、拜仁慕尼黑，以娴熟的技术和华丽的配合打法而名噪一时。不过2003/2004赛季，欧洲最佳射手马凯以1875万欧元的身价出走德甲拜仁慕尼黑，令主帅伊鲁埃塔顿失股肱。进入2004/2005赛季，吝啬成为这个夏天拉科鲁尼亚的主题。没有球员引进怎么能让球迷和队员对拉科鲁尼亚产生希望呢？不仅没有强援入队，奈贝特等人倒是远走英超，最后拉科只获得联赛第九名，主帅伊鲁埃塔也黯然离队。在2005夏季的转会市场上拉科继续着“贩卖”球星的主题，卢克、潘蒂亚尼都相继离开了球队，“超级拉科”时代告一段落。
从1992年到2004年，“超级拉科”时代的12年间，共获得1次西甲冠军、4次西甲亚军、3次西甲季军；连续5年参加欧洲冠军联赛取得了出色战绩，欧足联积分排名在2004年跃居欧洲俱乐部第5位。超级拉科以华丽的打法被大量球迷所欣赏，更以频频创造奇迹而激情四射：升入西甲第二年便获得亚军；2002年在皇马的百年庆典上击败皇马捧起国王杯；冠军联赛0比3落后于巴黎圣日尔曼的情况下下半场连进4球逆转；2002/2003赛季落后西甲领头羊11分的情况下连战连捷，在第33轮登上第榜首；冠军联赛首回合1比4负于AC米兰之后第二回合4比0逆转。“超级拉科”总是呈现给世人惊喜，令球迷难忘。
2012-2013赛季拉科再次保级失败，2013-14赛季征战乙级联赛。
2013-2014赛季拉科再次升级成功，2014-15赛季征战甲级联赛。
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